Criação do Instituto Biológico (IB) em 1924 quando a economia paulista foi sacudida pela doença do café. Daí nasceram os primeiros estudos que foram a semente para o Instituto.
O Casarão foi construído na década de 40, foi primeiramente residência de alguns diretores gerais do Instituto Biológico. Em 1981, Vicente do Amaral exercendo o cargo de Diretor Geral do IB, visou a implantação do Museu do Instituto Biológico nesse Casarão (idéia de Oswaldo Giannotti, Diretor do IB na década de 70) e colocou uma enorme placa com os dizeres “Futuras instalações do Museu do Instituto Biológico”
porém por conjunturas políticas, insere no Casarão a Diretoria do Centro de Pesquisa Laboratorial até 1996. Em 1997 são transferidos para o Casarão, os Museus de: Anatomia Patológica, de Patologia Vegetal, e de Pragas Agrícolas. Em 8 de novembro de 2004 aconteceu a inauguração do Museu do Instituto Biológico, com objetivo de ser um local para interagir com a comunidade.